很多精油有杀菌效果，是很好的消毒剂

所有的精油都具有杀死细菌或抑制菌丛生长的功效，有些精油只能杀死一两种微生物，而有些精油具有非常广泛的杀菌效果。少量精油就有杀死病毒或抑制其生长的效果。有些精油的杀菌效果比化学杀菌剂的作用力还强（例如：实验室所用的标准杀菌剂酚类）。佛手柑、丁香（图）、尤加利、杜松、薰衣草、茶树和百里香等都有非常好的杀菌效果。

这几种精油都是很好的房间消毒剂，特别适合消毒传染病病房。将大量精油溶在水中调成髙浓度的溶液可清洗房间的地板、摆饰，但最好的杀菌法是在空气中喷洒精油。可用空气喷雾器、精油熏灯、喷雾产生器（最有效率的方法）等装置，也可以直接将精油滴在灯泡或电暖器上，让空气中充满精油蒸汽。